Varsayılan olarak, denetlenen bir aygıtı Apple Configurator'e bağladığınızda, söz konusu aygıta kullanıcı tarafından yüklenmiş tüm uygulamalar silinir.
Apple Configurator v1.1 veya sonrasında, Apple Configurator menüsünün Preferences (Tercihler) kısmında bu ayarı değiştirebilirsiniz.